Цитата: 12.08 выданы денежные средства на командировку. Авансовый отчет утвержден 26.08. Расчет по сверхнормативным суточным предоставляется в конце месяца вместе с зарплатой.
Всё правильно.
Датой фактического получения дохода в данном случае считается последний день месяца, в котором утвержден авансовый отчет.
Авансовый отчет утвержден 26 августа, значит дата фактического получения дохода в виде сверхнормативных суточных - 31 августа.
Цитата: Удержан и перечислен НДФЛ при выплате зарплаты 05 сентября. В 6-НДФЛ это выгладит так:стр. 100 31.08.2016стр .110 05.09.2016стр. 120 06.09.2016
Всё правильно.
Цитата: При формировании справки 2-НДФЛ этот доход (в размере превышения суточных) отражается в сентябре.
А почему в сентябре?
Ведь дата фактического получения дохода - 31 августа. Значит и
показывать этот доход надо в августе - по дате фактического получения дохода.
Смотрим первоисточник:
Цитата: 1. В целях настоящей главы, если иное не предусмотрено пунктами 2 - 5 настоящей статьи,дата фактического получения доходаопределяется как день:...6)последний день месяца, в котором утвержден авансовый отчетпосле возвращения работника из командировки;
Успехов!